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チュートリアル
Seaborn
「NumPyを用いた散布図の理解:同じサイズのX配列とY配列の確保」

NumPyを用いた散布図の理解:同じサイズのX配列とY配列の確保

Pythonにおけるデータ可視化において、K-Meansなどの機械学習アルゴリズムに対して散布図を作成することは基本的な要素です。しかしながら、これらのグラフをプロットする際に、異なるサイズのNumPy配列の問題に直面することがよくあります。本記事では、効率的な散布図プロットのためにX配列とY配列のサイズを整列する方法について詳細な説明を提供します。

背景: 問題

18の要素を持つ1つのX配列と19の要素を持つ1つのY配列を含む37のNumPy配列があると想像してみてください。matplotlibのscatter関数を使用してこれらの値をプロットしようとします。しかし、"x and y must be the same size"というValueErrorが発生します。「x」と「y」の配列の要素数が同一でなければならないためです。

核心問題

scatter関数は、matplotlibにおいて強力なツールであり、2つの変数を互いにプロットすることができます。X配列とY配列に同じ数のデータポイントが必要です。エラーは、これらの配列のサイズが一致しない場合に発生します。例えば、X配列に18個の要素があり、Y配列には19個の列がある場合です。

解決の試み

Xから2つの列を1つに結合してサイズを等しくしようとするかもしれません。しかし、これにより別の問題が発生します:Xの新しい列はNumPy配列であり、他の列と同様のfloat型ではありません。その結果、別のValueErrorが発生することになります。「setting an array element with a sequence.」

解決策:すべての要素をプロットすること

解決策は、散布図は本質的に2次元であるという理解にあります。それは、2つの変数の関係性を表しますが、37ものデータを直接散布図にプロットすることは不可行です。しかしながら、K-Meansアルゴリズムを適用する前に、Seabornライブラリからpairplotを使ってデータを可視化することができます。Pairplotは、データセット内のペアごとの関係性をプロットすることができます。この方法により、37の配列のそれぞれの関係性と分布を調べることができます。

import seaborn as sns
import pandas as pd
 
# f1、f2、...、f37が1次元のNumPy配列だとして
df = pd.DataFrame(list(zip(f1, f2, f3, ..., f37)), columns=['f1', 'f2', 'f3', ..., 'f37'])
sns.pairplot(df)

このコードは、各変数をデータのy軸に沿って1行で共有し、列に沿ってx軸を共有するようなAxesグリッドを生成します。

結論

散布図は、2次元であるという制約があります。すべてのデータポイントを同時に見ることは魅惑的に思えるかもしれませんが、それは混乱と誤った結果をもたらす可能性があります。代わりに、Pairplotを使用するか、高次元データを扱っている場合はPCAなどの次元削減技術を検討してください。

成功したデータ可視化の鍵は、複雑なプロットだけではなく、提供される明確な洞察にあります。